Bio Apps Bildanalysetools für Zellbiologie- und Krebsforschung in den Biowissenschaften

Diese App zählt Zellen basierend auf der Erkennung einzelner Zellkerne per Zellkernmarkierungen oder Phasenkontrast. Sie eignet sich für Endpunkt-Assays wie etwa Assays zur Proliferation, zur Viabilität oder zur Transwell-Migration sowie für andere Assays, die die Anzahl Zellen in einem bestimmten Bereich ermitteln.

Diese App ermittelt den Bereich des Sehfelds, der mit Zellen überwachsen ist, und zieht dazu in erster Linie die Abweichungen der Bildpixel von den Phasenkontrast- oder Fluoreszenzkanälen heran. Die App wurde speziell für Scratch-Assays entwickelt, eignet sich jedoch auch für die Bestimmung des allgemeinen Zellwachstums.

Mit dieser App werden Proteinexpressionen in oder nahe dem Zellkern einer einzelnen Zelle festgestellt. Der Messbereich wird mit flexibel anpassbaren Werten für Abstand und Breite von der Außenmembran des Zellkerns bestimmt. So lassen sich präzise Analysen in beliebigen Zellkompartimenten durchführen. Es werden verschiedene Genexpressions- oder Reportersignale erfasst, meist in Transfektions-, Reporter-, Apoptose- oder ähnlichen Assays.

Spot Detection ermöglicht die Quantifizierung zellulärer Signale, die in Form von Sprenkeln auftreten. Über einen flexiblen Messbereich, dessen Abstand und Breite von der Außenmembran des Zellkerns festgelegt werden kann, lassen sich beliebige Teilbereiche der Zellen messen. Spot Detection eignet sich zum Zählen von Organellen, Nuclear Speckles, nukleären Subkompartimenten und ähnlichen Objekten.