Connect Toolkit: Nahtlose korrelative Bildgebungsexperimente in der biowissenschaftlichen Forschung
ZEN SOFTWARE TOOLKITS

Connect Toolkit Korrelative Bildgebungsexperimente in der biowissenschaftlichen Forschung

Das Connect Toolkit ist die ideale Lösung für eine vielseitige korrelative Bildgebung. Mit intuitiven Tools für die Ausrichtung und Registrierung ermöglicht es die mühelose multimodale Bilderfassung auf Imaging-Systemen von ZEISS. Sie behalten das große Ganze stets im Blick.

  • Mühelose Probennavigation
  • Intelligente Datenorganisation
  • Mehrskalige Perspektiven für neue Erkenntnisse

Discover ZEN Connect Toolkit

See how it revolutionizes correlative life science workflows in less than 60s.

Tauchgefrorene Adenokarzinomzellen auf Saphirscheiben. Alle ROIs werden in ZEN Connect im Kontext dargestellt.

Tauchgefrorene Adenokarzinomzellen auf Saphirscheiben. Alle ROIs werden in ZEN Connect im Kontext dargestellt.

Tauchgefrorene Adenokarzinomzellen auf Saphirscheiben. Alle ROIs werden in ZEN Connect im Kontext dargestellt.

Mehrskalige Perspektiven für neue Erkenntnisse

Erhalten Sie neue Einsichten mit multimodalen Daten in unterschiedlichen Maßstäben

Mit korrelativer Mikroskopie erhalten Sie beispiellose Einblicke in Ihre Proben. Durch die Kombination von Licht- und Elektronenmikroskopen erleichtert das Connect Toolkit solche Experimente mithilfe von vordefinierten Konfigurationen für Standard-Probenhalter, präzisen Kalibrierungsvorgängen zur Ausrichtung von Tischen und der Möglichkeit zur Anzeige von Bilddaten in unterschiedlichen Maßstäben. Erleben Sie Imaging völlig neu und erhalten Sie ein umfassendes Verständnis Ihrer Proben – mit dem Connect Toolkit.

Korrelativer Kryodatensatz in ZEISS ZEN Connect

Korrelativer Kryodatensatz in ZEISS ZEN Connect

Korrelativer Kryodatensatz in ZEISS ZEN Connect

Mühelose Probennavigation

Behalten Sie das große Ganze während der Bildaufnahme stets im Blick

Es ist bei Bildgebungsexperimenten immer von Vorteil, den Blick für die Probe in ihrer Gesamtheit nicht zu verlieren. Der spezielle Correlative Viewer zeigt die Übersichtsbilder aller relevanten Probenteile und ermöglicht damit eine geführte Probennavigation. Während der Aufnahme von Details können Sie mit dem Viewer schnell und einfach den Tisch an jede beliebige Interessensregion bewegen. 

Automatisiertes Slide Scanning und Detailuntersuchungen mit anderen ZEISS Mikroskopsystemen, kombiniert in einem ZEN Connect Projekt

Automatisiertes Slide Scanning und Detailuntersuchungen mit anderen ZEISS Mikroskopsystemen, kombiniert in einem ZEN Connect Projekt

Automatisiertes Slide Scanning und Detailuntersuchungen mit anderen ZEISS Mikroskopsystemen, kombiniert in einem ZEN Connect Projekt

Intelligente Datenorganisation

Werfen Sie alles in einen Topf 

Das Connect Toolkit hilft Ihnen dabei, Ihre Daten auf intelligente Weise zu organisieren. Machen Sie sich die Arbeit nicht mehr unnötig kompliziert, indem Sie große Bilddatensätze gemeinsam in einen Ordner ablegen. Die manuelle Datenablage und komplizierte Zugriffswege gehören der Vergangenheit an: Mit dem Connect Toolkit speichern Sie alle Ihre Bilder direkt im Kontext in einem übergeordneten Datencontainer. Dank der einfachen Navigation ist in der Connect Oberfläche jedes Bild dennoch nur einen einzigen Klick entfernt.

Kalibrierungs- und Ausrichtungsvorgänge mit dem Connect Toolkit

Die korrelative Mikroskopie umfasst dem Namen entsprechend verschiedene Bildgebungsmodalitäten. Jede davon erfordert normalerweise eine spezielle Ausrichtung oder Kalibrierung des Tischs. Das Connect Toolkit enthält mehrere Optionen für die Positionierung einer Probe vor und nach der Aufnahme und unterstützt Sie so dabei, optimale Bildresultate zu erzielen. Die verfügbaren Optionen werden im folgenden Abschnitt vorgestellt.

2D Ausrichtung

  • Ausrichten

    Ausrichten

    Einfache Ausrichtung: Verschiebung, Rotation, Skalierung oder Scherung von Bilddaten im Correlative Viewer. Optische Ausrichtung eines hochaufgelösten Übersichtsbilds auf eines mit niedriger Auflösung.

  • Manuelle-Ausrichtungs-Assistent

    Manuelle-Ausrichtungs-Assistent

    Wie die einfache Ausrichtung, aber mit einem eigenen Assistenten. Werte für die Translation, Rotation, Skalierungen und Scherung werden manuell eingegeben.

  • Punkt-Ausrichtungs-Assistent

    Punkt-Ausrichtungs-Assistent

    Mit einer geteilten Ansicht zur Vorgabe von Referenzpunkten, um Positionen von Interesse festzulegen. Translation, Rotation oder Skalierung eines Bilds erfolgen mit mindestens drei einzelnen, übereinstimmenden Referenzpunkten.

3D Ausrichtung

  • 3D Ausrichtung

    3D Ausrichtung

    Ein Add-on, um die dreidimensionale Rotation von 3D-Datensätzen aus falsch ausgerichteten korrelativen Bildgebungsexperimenten zu ermöglichen und Probleme bzgl. der Kameraperspektive zu beheben.

  • Punktausrichtung 3D Assistent

    Punktausrichtung 3D Assistent

    Für die Eingabe von Referenzpunkten an beliebigen Positionen in einem 3D-Datensatz. Der Algorithmus führt Translationen und XY-Rotationen durch.

  • Zwei Bilder in 3D ausrichten

    Zwei Bilder in 3D ausrichten

    Der Tomo3D Viewer ermöglicht die Translation von zwei 3D-Stapeln in eine beliebige 3D-Ebene. 3D Toolkit erforderlich.

Tischkalibrierung

  • System ausrichten

    System ausrichten

    Anders als bei der einfachen Ausrichtung wird bei dieser Option auch der Tisch neu kalibriert. Für die Systemkalibrierung werden benutzerspezifische Referenzpunkte herangezogen.

  • Shuttle & Find

    Shuttle & Find

    Für Probenhalter mit festen Referenzpunkten, die die Kalibrierung der Tischposition, des Maßstabs und des Kamerawinkels ermöglichen.

Connect Basisfunktionalität vs. Connect Toolkit

Einige der grundlegenden Funktionen für die korrelative Mikroskopie stehen bereits in der ZEN Basissoftware zur Verfügung. Mit dem Connect Toolkit haben Sie jedoch Zugriff auf alle erhältlichen Funktionen für die korrelative Mikroskopie. Diese Tabelle dient zur übersichtlichen Gegenüberstellung der Funktionen beider Versionen.

Connect Basisfunktionalität
Connect Toolkit

Correlative Viewer / Projekt

x

x

Ausrichten / System ausrichten

x

x

Auto-Registrierung mit kalibriertem Tisch

x

x

Bildaufnahme / -import in .czi

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x

Tischsteuerung über den Viewer

x

x

Zwei Bilder in 3D ausrichten

3D Toolkit erforderlich

3D Toolkit erforderlich

Messungen im Correlative Viewer

x

Definition und Abruf von ROI (auf zweitem System)

x

Shuttle & Find

x

Ausrichtungs-Assistenten / 3D-Ausrichtung (Z-Richtung)

x

BioFormats und FIB-Stapel-Import

x

Erweiterter Bild-/ Videoexport (Projektansicht, SerialEM)

x

Punktausrichtung im Connect Toolkit

Probe mit Referenzpunkten mühelos ausrichten

Downloads

    • ZEISS ZEN Connect

      Overlay and Organize Images From Any Source to Connect Your Multimodal Data

      Dateigröße: 2 MB

Visit the ZEISS Download Center for available translations and further manuals.

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