Lleve el análisis de fenotipo celular a otro nivel de detalle y automatización

El recuento de núcleos es una de las tareas más comunes de análisis de fenotipos celulares para la investigación biológica. La automatización de este proceso es crucial para un gran número de aplicaciones y otros análisis posteriores. Este flujo de trabajo se basa en un modelo de aprendizaje profundo entrenado previamente y segmenta, separa y cuenta núcleos automáticamente basándose en cualquier tipo de marcador nuclear de fluorescencia, como DAPI, en una o más imágenes de microscopía. Admite imágenes de series temporales, así como mediciones en placas multipocillo. El resultado es una matriz que muestra el número de núcleos por imagen en cada pocillo por punto temporal (si procede). El correspondiente modelo de aprendizaje profundo se entrena con conjuntos de datos de varios microscopios con diferentes resoluciones y aumentos.

El cribado fenotípico es un enfoque independiente del objetivo para el descubrimiento de fármacos que monitoriza los cambios fenotípicos en células. Esta aplicación permite realizar un análisis cuantitativo de alto rendimiento de placas multipocillo que proporciona resultados sobre varias intensidades subcelulares y mediciones morfológicas en modelos celulares complejos. En este ejemplo, se utiliza un marcador nuclear para identificar todas las células y se identifican poblaciones de una célula específica basándose en combinaciones de marcadores nucleares y citoplásmicos. Los marcadores citoplásmicos también se emplean para caracterizar por separado la forma y el tamaño de todas las células que expresan este marcador.