Análisis de imágenes de microscopía basado en IA en las industrias farmacéutica y biotecnológica
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Análisis de imágenes de microscopía basado en IA en las industrias farmacéutica y biotecnológica

Extraiga descubrimientos revolucionarios a partir de conjuntos de datos grandes y complejos

La explosión de la investigación biomédica brinda oportunidades a las industrias farmacéutica y biotecnológica para desarrollar nuevos medicamentos, aplicaciones y tecnologías. La innovación requiere diseños experimentales complejos que dan lugar a conjuntos de datos multidimensionales inmanejables. Sin un análisis automatizado, las empresas se encuentran con dificultades para pasar de la recopilación de datos a descubrimientos revolucionarios. El análisis de imágenes basado en IA de ZEISS aborda tres dificultades principales para contribuir a la innovación:

  • Perspectivas: Analice los datos de las imágenes para extraer lecturas exhaustivas.
  • Automatización: Incremente el rendimiento y la eficiencia con grandes volúmenes de datos.
  • Reproducibilidad: Obtenga resultados fiables hoy y mañana, para todos los usuarios y en todos los centros.
Segmentación de núcleos celulares basada en métodos convencionales de análisis de imágenes

Segmentación de núcleos celulares basada en métodos convencionales de análisis de imágenes

Segmentación de núcleos celulares basada en métodos convencionales de análisis de imágenes

Segmentación de núcleos celulares basada en métodos convencionales de análisis de imágenes

Segmentación de núcleos celulares basada en métodos convencionales de análisis de imágenes

Las limitaciones del análisis de imágenes clásico

Los investigadores en biotecnología y descubrimiento de fármacos llevan tiempo buscando métodos para automatizar el análisis de imágenes. El abordaje habitual ha sido aplicar una secuencia de funciones de procesamiento (como suavizado, detección de bordes, etc.) seguida de una segmentación basada en umbrales. Estas secuencias pueden configurarse para establecer canalizaciones analíticas básicas destinadas a tareas típicas, como la identificación y el recuento de núcleos, células y otras prestaciones subcelulares de interés. A pesar de su potencial para muchas tareas estándar de análisis de imágenes, esta segmentación de imágenes clásica basada en umbrales presenta limitaciones que pueden causar importantes contratiempos para el análisis a gran escala de conjuntos de datos complicados.

Estos algoritmos solo tienen en cuenta un pequeño subconjunto de parámetros de la imagen, sobre todo la luminosidad. Las imágenes deben ser muy uniformes en cuanto a la intensidad de la señal objetivo y la homogeneidad del fondo. Estas canalizaciones suelen fallar con conjuntos heterogéneos de imágenes, lo que provoca artefactos o análisis incompletos. Construir y probar las canalizaciones requiere experiencia y el dominio de algoritmos analíticos. Esta dependencia de un conjunto de conocimientos específicos puede dar lugar a resultados contradictorios cuando existe un nivel heterogéneo de especialización entre los científicos que realizan el análisis de imágenes, o cuando se carece por completo de los conocimientos necesarios.

Aproveche la inteligencia artificial para impulsar el análisis automatizado de imágenes
Aproveche la inteligencia artificial para impulsar el análisis automatizado de imágenes

Aproveche la inteligencia artificial para impulsar el análisis automatizado de imágenes

La inteligencia artificial (IA) permite a los ordenadores imitar la inteligencia humana. La IA puede aprender a identificar objetos en imágenes sin que se programe explícitamente, de forma similar a como aprendemos los seres humanos.

Una de las formas de IA es el aprendizaje automático (AA), que permite a las máquinas aprender extrayendo patrones de características de los datos. El AA puede evaluar funciones más allá de la intensidad de píxeles, p. ej., la información textural, que arroja resultados más sólidos a partir de conjuntos de datos que incluyen imágenes muy variables.

El aprendizaje profundo (AP) es una forma especializada de AA que aprende a partir de la interpretación de grandes cantidades de datos con millones de parámetros. Si bien requiere más datos para alimentar el algoritmo, el AP puede imitar la forma en que múltiples capas de neuronas en red tratan los datos, lo que le permite procesar con éxito conjuntos de datos muy complejos y difíciles de segmentar.

Células de osteosarcoma
Células de osteosarcoma

Células de osteosarcoma que muestran núcleos teñidos con DAPI en azul (izquierda); núcleos segmentados mediante aprendizaje automático tradicional (centro); segmentación seguida de separación divisoria de los núcleos individuales (derecha)

Células de osteosarcoma que muestran núcleos teñidos con DAPI en azul (izquierda); núcleos segmentados mediante aprendizaje automático tradicional (centro); segmentación seguida de separación divisoria de los núcleos individuales (derecha)

Las canalizaciones con IA arrojan resultados sobresalientes en escenarios difíciles

Entrenamos la IA utilizando un subconjunto representativo de imágenes que contienen características de interés, p. ej., núcleos celulares. En lugar de definir una secuencia de pasos del procesamiento para lograr un resultado de segmentación deseado (como en el análisis de imágenes convencional), el resultado deseado se refuerza con el entrenamiento, y la IA optimiza el algoritmo de forma automática para lograr esta misma segmentación. Las canalizaciones analíticas con IA arrojan resultados sobresalientes, incluso cuando se aplican a escenarios particularmente difíciles para la captura de imágenes, como imágenes con bajo contraste (p. ej., sin marcadores) e imágenes con altas densidades de objetos (p. ej., cultivos celulares o tejidos confluentes). Asimismo, las canalizaciones con IA se automatizan rápidamente y se aplican a grandes conjuntos de datos para extraer perspectivas contundentes y estadísticamente relevantes sobre los fenómenos biológicos.

Ecosistema de ZEISS para el análisis de imágenes basado en IA

Ecosistema de ZEISS para el análisis de imágenes basado en IA

Ecosistema de ZEISS para el análisis de imágenes basado en IA

Ecosistema de ZEISS para el análisis de imágenes basado en IA

Los flujos de trabajo para el análisis de imágenes basado en IA combinan una segmentación y clasificación de imágenes precisas con la automatización para lograr análisis de datos reproducibles y de alto rendimiento. Al aplicar flujos de trabajo de análisis por IA, los equipos de investigación biofarmacéutica pueden aumentar su éxito en la identificación y el desarrollo de mejores fármacos candidatos, desde la investigación preliminar y el descubrimiento hasta los estudios preclínicos, los estudios que permiten solicitar el PEI (producto en fase de investigación clínica) y mucho más.
El beneficio es doble:

  • Evitar los elevados costes del desgaste asociados a los fracasos en fases avanzadas del desarrollo.
  • Obtener una ventaja competitiva acelerando el tiempo hasta la comercialización.

Las soluciones de software de ZEISS ayudan a los usuarios de todos los niveles de experiencia a aprovechar la IA y aumentar la productividad:

  • La plataforma de aprendizaje arivis Cloud basada en la nube permite un marcado fácil y eficaz de conjuntos de datos de entrenamiento para el desarrollo de modelos de aprendizaje profundo, sin necesidad de que los usuarios tengan conocimientos de codificación.
  • Los modelos de aprendizaje profundo pueden implementarse en el software ZEISS ZEN como parte de un entorno de análisis de imágenes o un flujo de trabajo optimizado con Bio Apps.
  • Si su tarea analítica es muy compleja o si el tamaño de los datos es muy grande, su canalización analítica se beneficiará de la implementación en arivis Pro: un paquete de alta eficiencia de análisis de imágenes para conjuntos de datos multidimensionales complicados. Por último, conecte sus canalizaciones analíticas con IA a la plataforma de análisis basada en servidor arivis ProHub y mejore la tecnología analítica de arivis Pro con un mayor rendimiento y escala.

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    Las imágenes mostradas en esta página representan contenidos de investigación. ZEISS descarta explícitamente la posibilidad de hacer un diagnóstico o recomendar un tratamiento para pacientes posiblemente afectados en base a la información generada con el escáner de portaobjetos Axioscan 7.