Analyse d'image alimentée par l'IA pour la recherche et l'analyse des organoïdes

L'analyse automatisée est importante pour quantifier les effets de médicaments sur la croissance d'organoïdes et la différenciation cellulaire en leur sein.

Cette solution peut être utilisée pour segmenter les organoïdes, leur lumen et les noyaux qui s'y trouvent à l'aide d'une combinaison d'outils d'IA et d'étapes d'analyse d'images conventionnelle sur ZEISS arivis Pro. Les masques des noyaux permettent de segmenter les corps des cellules individuelles au sein de la couche externe des organoïdes.

La segmentation des organoïdes et des cellules internes révèle plusieurs indicateurs tels que le volume de l'organoïde et du lumen, la rondeur des organoïdes et le nombre de cellules par organoïde. Par ailleurs, l'expression de marqueurs peut être analysée au niveau d'une cellule et le pourcentage de cellules à marqueur positif est indiqué. Cette analyse peut être effectuée pour des images individuelles ou pour des centaines d'images acquises en utilisant des plaques multipuits. Avec ZEISS arivis Hub, l'analyse d'organoïde en 3D est augmentée pour inclure de nombreux organoïdes différents.

Dans ce webinaire, notre experte, Dr Sandra Lemke, présente comment analyser des images d'organoïdes en 2D et 3D avec l'IA sans qu'il soit nécessaire de savoir programmer. Nous présentons un pipeline de bout en bout qui livre des résultats reproductibles pour vous aider à suivre la croissance et la différenciation des organoïdes.