Gestion des données

Parallèlement à l'évolution des instruments d'imagerie, les ensembles de données augmentent en volume et en nombre de dimensions. La gestion de ces ensembles de données pour la visualisation en 3D, 4D ou 5D devient un défi informatique de plus en plus complexe. Disposer d'outils logiciels opérationnels dans votre installation pour faire face aux tailles et volumes de données est essentiel pour permettre à vos utilisateurs de visualiser et ensuite de quantifier la structure ou les événements d'intérêt dans leurs ensembles de données multidimensionnels. Une combinaison de calcul haute puissance et de logiciels optimisés pour gérer rapidement ces ensembles de données est essentielle pour garantir à vos utilisateurs la possibilité de « voir » en détail les données qu'ils ont acquises avec votre instrumentation.

En fonction de la taille et de l'étendue des exigences, ZEISS propose différentes recommandations pour visualiser les données :

• arivis Vision4D : votre logiciel modulaire pour travailler avec les images multicanaux 2D, 3D et 4D de taille quasiment illimitée. Si vos utilisateurs travaillent régulièrement avec des ensembles de données de plus de 100 Go, arivis Vision4D est la solution recommandée par ZEISS. La technologie unique ImageCore est indépendante de la RAM, arivis Vision4D vous donne ainsi, à vous et à vos utilisateurs, la possibilité de gérer des ensembles de données sans contraintes.
• Logiciel ZEISS ZEN : l'interface utilisateur utilisée pour tous les microscopes optiques ZEISS est livrée avec le moteur de visualisation 3D intégré conçu par arivis. Cette conception garantit une gestion 3D fluide des ensembles de données jusqu'à ~100 Go dans un environnement logiciel familier. Les performances de ZEN dépendent du matériel, par exemple, plus de RAM et un disque SSD plus rapide peuvent améliorer considérablement la gestion des données volumineuses jusqu'à 500 Go.
• ZEISS ZEN lite : les outils de visualisation 3D gratuits disponibles dans ZEN lite sont également extrêmement performants. Ils offrent à vos utilisateurs une puissante visualisation d'images à partir de leurs propres ordinateurs.
  

Dans la plupart des cas, l'acquisition d'images n'est qu'une étape dans un processus expérimental complexe qui aboutit finalement à des données quantifiables. La façon dont les expériences sont planifiées et configurées ainsi que les choix ultérieurs pour le traitement et l'analyse sont tous essentiels pour garantir des résultats expérimentaux précis et reproductibles pour les utilisateurs de votre installation.

ZEISS propose une sélection d'options d'analyse d'images, ainsi qu'une large gamme de solutions faciles à utiliser contenues dans le logiciel d'acquisition, telles que les ZEN Bio Apps. Pour les applications exigeant une analyse plus complexe ou impliquant de grands ensembles de données de plus de 100 Go, la plate-forme arivis Vision4D est une solution puissante. Lorsqu'un concept d'analyse personnalisé est requis, la plateforme APEER propose une solution basée sur le cloud qui offre une très grande flexibilité en plus d'une transparence totale. Toute nouvelle fonction d'analyse programmée par des chercheurs peut être rapidement et facilement intégrée dans les processus de vos utilisateurs à l'aide d'APEER, sans pour autant avoir besoin de connaissances en programmation. La transparence totale en termes de concept de traitement vous est en outre garantie.

L'étape de traitement d'images tend à devenir un goulot d'étranglement dans l'obtention d'informations à partir de données d'imagerie. Il est donc essentiel de disposer des dernières tendances de traitement et d'analyse pour rester à l'avant-garde des expériences évolutives créées par les utilisateurs des installations.

À mesure que la puissance de calcul augmente, la capacité et la disponibilité des approches pour entraîner les réseaux neuronaux à reconnaître ou à différencier les caractéristiques d'intérêt augmentent en conséquence. Choisir la meilleure approche d'apprentissage automatique pour la segmentation, la restauration ou la classification est déterminant pour le succès et la reproductibilité de vos résultats. Que l'objectif soit de segmenter des objets d'intérêt particuliers ou d'identifier des régions de l'échantillon pour une acquisition ultérieure, être au fait des nombreux développements et approches de l'apprentissage automatique permet de fournir des résultats optimaux aux utilisateurs de votre installation.

ZEISS propose un large choix d'outils d'apprentissage automatique pour répondre aux besoins de toutes les applications. ZEISS ZEN Intellesis est un moyen simple et rapide de former et de déployer la segmentation. Le bouton-poussoir du module, par exemple, est idéal dans l'environnement du centre d'imagerie lorsque la facilité d'utilisation est souvent un facteur clé dans l'intégration des utilisateurs à l'approche mise en œuvre. De plus, les réseaux neuronaux d'apprentissage en profondeur peuvent être formés à l'aide de notre plate-forme APEER ou via des réseaux accessibles au public tels que U-Net, puis déployés à l'aide de ZEN Intellesis, offrant ainsi l'approche la plus flexible pour la segmentation par apprentissage automatique dans l'interface utilisateur commune de ZEISS, ZEN.

Si le temps ou la main-d'œuvre disponible est limité(e), ZEISS fournit également un service personnalisé pour former votre réseau neuronal afin que vous puissiez vous concentrer uniquement sur vos problématiques scientifiques. Contactez-nous si vous souhaitez en savoir plus sur ce service ou si vous avez besoin d'une solution personnalisée.