ZEISS arivis Pro
Solution pour l'analyse et la visualisation avancées d'images
Optimisez le potentiel de vos images grâce à nos puissants outils d'analyse et de visualisation d'images. Créez des pipelines d'analyse transparents en quelques clics. Traitez sans effort des ensembles de données volumineux sur des postes de travail compatibles. « Entrez dans votre échantillon » à l'aide de notre boîte à outils de VR et découvrez de nouvelles perspectives.
Pipelines d'analyse d'images flexibles et de bout en bout
ZEISS arivis Pro permet d'automatiser les pipelines d'analyse et de visualisation d'images. Exploitez les méthodes traditionnelles ou les modèles d'IA sans effort et créez des pipelines pour n'importe quelle dimension, modalité ou taille d'image, sans pour autant posséder de connaissances en programmation.
Le logiciel prend en charge et traite plus de 30 formats de fichier courants. Traitez efficacement et facilement les fichiers volumineux. Des pipelines préconfigurés et des tests standard sont disponibles pour les tâches d'analyse simples ou exigeantes. Vous pouvez également personnaliser des pipelines adaptés à vos objectifs spécifiques.
Un seul clic suffit pour reproduire votre analyse et obtenir des résultats quantitatifs cohérents. Améliorez votre productivité et obtenez des résultats reproductibles.
Analyse 3D avancée
Améliorez rapidement vos résultats grâce à l'IA, même pour les tâches complexes. Ajoutez des annotations aux coupes de votre pile Z afin d'entraîner votre modèle de segmentation et de classification, puis appliquez-les à l'ensemble de données. Utilisez localement des opérateurs d'apprentissage automatique et d'apprentissage profond ou entraînez des modèles dans le cloud, puis importez-les pour former le cœur de votre pipeline automatisé. Visualisez les résultats en 3D et créez des vidéos pour générer un rapport d'analyse soigné en quelques clics.
Analyse d'organoïdes en 3D
Analyse de contenu approfondie
La découverte de médicaments pour les pathologies complexes nécessite des méthodes d'analyse d'images avancées, telles que le dépistage avec vue élargie du phénotype cellulaire ou tissulaire, modulable de 2D en 4D. Entraînez un modèle d'IA à l'aide du logiciel ZEISS arivis sur le cloud ou localement, automatisez l'analyse d'images pour gagner du temps, réduire les biais humains et obtenir des résultats cohérents.
Tracking avec ZEISS arivis Pro VR
Tracking et lignage
Quantifiez la division cellulaire et les phénotypes migratoires, puis suivez les évolutions dans des ensembles d’images en 2D et 3D de différentes tailles. Utilisez ZEISS arivis Pro VR pour contrôler avec précision les pistes générées automatiquement dans un environnement de réalité virtuelle immersif. Appliquez à nouveau très facilement votre pipeline à d'autres ensembles de données.
Traçage 3D automatisé des tissus neuronaux (cerveau de souris).
Neurobiologie
Déployez des algorithmes avancés pour le traçage neuronal permettant une analyse automatique et reproductible de diverses images en un seul clic. Quantifiez les neurones, les cellules gliales / microgliales, les axones et bien plus encore, même avec un faible rapport signal sur bruit (SNR). Modifiez facilement les tracés à l'aide de nos outils interactifs semi-automatiques et de réalité virtuelle. Analysez les données des expériences passées, quel que soit le format de l'image.
ZEISS arivis Pro VR Toolkit
Découvrez votre échantillon sous un nouvel angle grâce à une expérience immersive de réalité virtuelle. Oubliez le clavier et la souris ! Vous pouvez directement déplacer, faire pivoter, changer d'échelle et configurer vos données d'images numériques. Vous ferez l'expérience d'une profondeur de vue équivalente au monde réel.
- Explorez votre échantillon en 3D
- Observez des détails sous différents angles
- Collaborez avec des collègues pour l'examen en direct de votre échantillon et de vos résultats
- Bénéficiez d'une commande vocale et manuelle conviviale
- Profitez de la relecture et de l'édition efficaces et interactives des résultats d'analyse automatique.
Convertir plus de 30 formats de fichiers image
Peu importe l'instrument utilisé pour créer votre image, le format ou la taille du fichier : le convertisseur ZEISS arivis SIS convertit facilement votre fichier image dans notre format SIS (Scalable Image Storage). Ainsi, vous pouvez explorer rapidement et de manière interactive vos images avec ZEISS arivis Pro, arivis Pro VR et arivis Hub. Gagnez un temps précieux, tout en conservant l'ensemble des données pour une analyse avancée.
- Prise en charge de la conversion de fichiers pour plus de 30 formats
- Mise en file d'attente de plusieurs tâches d'importation et de conversion
- Conversion par lots sans intervention
- Interface conviviale de gestion des tâches de conversion
- Utilisation au-delà des images de microscopie (p. ex., CT, MRI)
Points forts de la dernière version arivis Pro
Découvrez si vous pouvez bénéficier des dernières fonctionnalités disponibles avec la version la plus récente de ZEISS arivis Pro.
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Le logiciel ZEISS arivis place la personnalisation au premier plan de l'analyse d'images de microscopie
ZEISS arivis Pro 4.2 offre aux utilisateurs la liberté de choisir la méthode d'analyse d'image en fonction de leurs besoins.
La nouvelle version comprend des outils améliorés pilotés par l'IA, des fonctionnalités d'analyse en 3D et la gestion de grands ensembles de données. Le logiciel apporte une flexibilité inédite pour adapter les flux de tâches d'analyse d'image de microscopie afin de répondre aux questions inhérentes à la recherche.
Visionnez cette courte vidéo pour en savoir plus sur les dernières fonctionnalités.
goutte-à-goutte cellpose
Fonctionnalités
Nouveautés et à noter :
- Maillage et rendu optimisés pour un nombre illimité d'objets dans 4D Viewer
- Segmentation par instance (basée sur les objets) guidée par des modèles d'apprentissage profond entraînés sur ZEISS arivis Cloud
- Segmentation des cellules et des noyaux dans les images obtenues par microscopie au moyen de l'opération Cellpose
- La prévisualisation de haute précision dans le pipeline d'analyse peut utiliser des données en 3D pour produire une prévisualisation plus pertinente
- L'analyse peut afficher directement une prévisualisation dans 4D Viewer pour les opérations de création d'objets (p. ex. Neuron Tracer)
- L'apprentissage automatique peut optimiser automatiquement l'ensemble des fonctionnalités utilisées (pour améliorer les performances)
- Amélioration de la gestion d'un très grand nombre d'objets dans la table des objets
- Changement complet d'identité de la marque : Le logiciel s'appelle désormais ZEISS arivis Pro
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Récapitulatif des modifications de la version arivis Vision4D 4.1.2 du 16 novembre 2023
Segmenteur Cellpose :
- Amélioration : meilleurs contrôles de la mémoire pour éviter les erreurs internes
- Amélioration : des erreurs et des avertissements plus clairs
- Amélioration : meilleure description des modèles pré-entraînés disponibles dans l'aide
- Modification : l'exécution par plan est désormais activée par défaut
- Correction : traitement des résultats pour les points temporels autres que le premier (en combinaison avec les filtres de voxels)
- Correction : normalisation des données avec biais dans la valeur minimale de l'intensité
- Correction : autres petites corrections concernant le segmenteur Cellpose
Importation :
- Amélioration : importation des noms de canaux pour les données XDCE
- Correction : problèmes d'importation pour certaines séries temporelles ND2
Généralités :
- Amélioration : licence gratuite utilisée plus rapidement après avoir quitté l'application
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Neurosphères détectées à l'aide d'un modèle guidé par IA de cellpose pré-entraîné.
Récapitulatif des modifications de la version arivis Vision4D 4.1.1
du 25 juillet 2023Nouveautés et à noter :
- Segmenteur Cellpose - importer directement des modèles Cellpose pré-entraînés pour une segmentation facile et rapide dans le pipeline d'analyse
Analyse :
- Nouveauté : opération d'analyse native du segmenteur Cellpose (pas besoin de Python)
- Nouveauté : exporter un modèle créé avec le Deep Learning Trainer en tant que CZANN
- Amélioration : apprentissage profond - meilleure compatibilité avec les modèles N2V de ZEISS ZEN
- Amélioration : l'option Allow Holes est activée par défaut pour le segmenteur à apprentissage profond
- Amélioration : meilleure validation des conflits lorsque les entraînements d'apprentissage profond sont renommés
- Correction : rare cas où les positions des pistes après l'analyse à l'échelle sont incorrectes
- Correction : référence de segment potentiellement erronée pour le corps de la cellule dans une trace
4D Viewer :
- Amélioration : le zoom automatique lors d'un double clic sur un objet est plus simple à utiliser dans 4D Viewer
- Correction : parfois, les traces (dans le style d'affichage des cônes) ne pouvaient pas être sélectionnées dans 4D Viewer
Généralités :
- Nouveauté : fournir une description et un téléchargement hors ligne pour les composants en option dans le programme d'installation
- Correction : amélioration de la compatibilité pour l'importation DeltaVision DV
- Correction : What's New s'ouvre de manière plus fiable après une mise à jour
- Correction : le programme d'installation vérifie qu'aucun fichier des anciennes versions Vision4D ne subsiste dans le dossier d'installation
- Petites corrections et améliorations supplémentaires dans la bibliothèque arivis_dl
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Opération d'entraînement pour l'apprentissage profond
Récapitulatif des modifications de la version arivis Vision4D 4.1
du 27 novembre 2023Nouveautés et à noter :
- Nouveau module optionnel : arivis AI toolkit offre un flux de tâches complet d'apprentissage profond directement dans Vision4D - annotation, entraînement et inférence
- Diverses améliorations dans le flux de tâches de traçage
- Wellplate Editor permet d'attribuer manuellement des ensembles d'images aux puits ou aux champs d'un puits
arivis AI toolkit :
- Nouveauté : module optionnel arivis AI toolkit
- Nouveauté : panneau Deep Learning Trainer pour configurer et entraîner un modèle d'apprentissage profond
- Nouveauté : utiliser Draw Tool pour dessiner des segments afin d'annoter les régions pour les classes
- Nouveauté : utilisation d'annotations éparses pour éviter d'avoir à dessiner sur chaque pixel
- Nouveauté : les objets dessinés sont triés par ordre de classe - les pixels sont attribués à l'objet le plus élevé (inutile de couper les chevauchements)
- Nouveauté : ajouter et réutiliser des segments existants pour la définition de classe
- Nouveauté : regroupement automatique basé sur un arrière-plan annoté
- Nouveauté : exécuter et contrôler le processus d'entraînement d'apprentissage profond directement à partir de Vision4D
- Nouveauté : ouvrir directement le modèle d'apprentissage profond entraîné dans le pipeline d'analyse pour inférence
- Nouveauté : exporter le modèle d'apprentissage profond entraîné en tant que ONNX
- Nouveauté : pack d'installation supplémentaire pour configurer un environnement d'apprentissage profond Python complet
Formats de fichiers image pris en charge
Téléchargements
Parler à un expert
N'hésitez pas à nous contacter pour en savoir plus sur ZEISS arivis Pro, le logiciel d'analyse d'images de microscopie. Vous pouvez compléter et envoyer ce formulaire. L'un de nos représentants sera heureux de vous aider.