BOÎTES À OUTILS DU LOGICIEL ZEN

2D Toolkit

Analyse d'images de base dans la recherche en sciences de la vie

Analysez les échantillons avec précision à l'aide de 2D Toolkit. Un assistant convivial facilite l'installation et vous permet de contrôler entièrement le processus, pour une exécution efficace et facile des tâches.

Analyse professionnelle d'image nécessitant peu de connaissances spécialisées
Flexibilité pour affiner les classes, les paramètres et les caractéristiques
Choix d'algorithmes de segmentation conventionnels et basés sur l'IA
Résultats d'analyse soignés et interactifs

Analyse professionnelle d'image nécessitant peu de connaissances spécialisées

Une aide efficace, l'assurance de bons résultats

Que l'analyse d'image soit complexe ne signifie pas qu'elle doit être difficile. L'assistant d'analyse d'images vous guide pas à pas dans la configuration de l'analyse. En quelques minutes à peine, vous pouvez définir vos classes d'intérêt, choisir une méthode de segmentation et les caractéristiques à extraire. Après avoir créé le script d'analyse, exécutez l'analyse et passez à une autre tâche, ou réutilisez-le sur d'autres ensembles de données afin de générer des résultats reproductibles.

Flexibilité pour affiner les classes, les paramètres et les caractéristiques

Chaque analyse présente des défis uniques

Une analyse optimale de l'image nécessite certains ajustements et dépend de la qualité de l'image, de la complexité de l'échantillon ou des questions scientifiques posées. L'assistant d'analyse d'image permet de créer plusieurs classes potentiellement imbriquées, de prétraiter des images de faible qualité, de choisir l'une des nombreuses méthodes de segmentation ou caractéristiques de mesure (pour l'extraction de données), ou même de configurer vos propres mesures.

Choix d'algorithmes de segmentation conventionnels et basés sur l'IA

Élargissez vos possibilités

Située au cœur de l'analyse d'une image, la segmentation est l'art d'identifier avec précision des objets d'intérêt sur la base de leurs propriétés visuelles. Afin de couvrir toutes les variations et complications possibles, l'assistant d'analyse d'image inclut plusieurs options telles que le seuil d'intensité, la segmentation basée sur la variance ou la segmentation dynamique. De même, l'assistant est compatible avec les modèles de segmentation d'apprentissage automatique et d'apprentissage profond Intellesis, notamment ceux importés depuis arivis Cloud.

Affichage soigné et interactif des résultats

Des résultats exploitables pour votre recherche

Une fois l'analyse terminée, vous obtiendrez des superpositions visuelles, un graphique configurable et des tableaux de données exportables. Les statistiques sont fournies à la fois au niveau de l'échantillon et au niveau des objets individuels. La fonction de graphique permet de visualiser toute caractéristique sous forme d'histogramme, de diagramme de dispersion ou de carte thermique, une fonction des plus pratiques pour les écrans de plaques de titrage. Toutes les données sont interconnectées, vous pouvez donc explorer de manière interactive toutes les observations expérimentales.

Un regard plus approfondi sur l'assistant d'analyse d'image

Définition flexible des classes L'assistant permet de définir plusieurs classes d'objets. De même, les hiérarchies complexes de classes imbriquées (« objets dans les objets ») peuvent être modélisées sans effort.

Traitement préliminaire et post-traitement L'assistant IA permet de prétraiter les images avant la segmentation (lissage de l'image, accentuation de la netteté et soustraction de l'arrière-plan), et de modifier les résultats de la segmentation à l'aide de filtres morphologiques ou d'opérations de découpage d'objets.

Filtrage flexible des objets Affinez les résultats de la segmentation par filtrage. L'assistant permet de filtrer selon une combinaison de caractéristiques d'objets et fournit un aperçu des objets sélectionnés et rejetés.

Caractéristiques et annotations L'assistant permet de sélectionner précisément les caractéristiques de l'objet adaptées qui sont nécessaires à l'analyse, mais aussi de personnaliser les annotations affichées dans le résultat.

Fonctionnalités personnalisées Définissez des caractéristiques personnalisées dans l'assistant IA pour calculer une combinaison de deux caractéristiques de base ou plus (par ex. des ratios, des produits...), avec des statistiques sur un seul objet ou un ensemble d'objets.
Segmenter des images binaires Ce segmenteur permet de transformer des masques d'images binaires importés (par ex. à partir d'une analyse externe) en objets ZEN à des fins d'analyse. Le filtrage de la taille des objets et le fractionnement des objets sont également activés.

Zones d'influence (ZOI) ZOI est une méthode de segmentation particulière qui permet d'analyser l'environnement d'un objet. Cela permet d'analyser certaines régions cellulaires, par exemple pour la translocation nucléaire de molécules de signalisation cellulaire.

Segmenteur à apprentissage automatique L'assistant d'analyse d'image intègre la segmentation par apprentissage automatique, disponible dans AI Toolkit. Les puissants algorithmes d'apprentissage automatique peuvent résoudre des problèmes de segmentation pour lesquels les algorithmes conventionnels échouent.

Segmenteur à apprentissage profond La segmentation sémantique ou d'instance basée sur l'apprentissage profond est sans doute la méthode la plus puissante à ce jour. L'assistant est compatible avec les modèles formés sur arivis Cloud ou des outils tiers.

Segmentation 3D En combinaison avec 3D Toolkit, l'assistant génère des objets 3D à partir d'une segmentation par seuil basée sur l'intensité. En outre, la segmentation 3D est compatible avec les modèles basés sur l'IA d'AI Toolkit et d'arivis Cloud.

Fonctions de traitement

Un renfort utile pour toutes les situations

La boîte à outils comprend plus de 170 fonctions de traitement d’image. Elle couvre les opérations géométriques, morphologiques, de lissage et d'affinage d'image ou binaires standard, mais aussi des fonctions de plus haut niveau telles que la segmentation ou la fonctionnalité Intellesis. Presque toutes les fonctions sont compatibles avec la macro-programmation et plus de 30 d'entre elles sont compatibles avec l'automatisation par lots.