ソフトウェア

ZEISS arivis Pro

高度な画像解析とビジュアライゼーションのためのソリューション

パワフルな画像解析・ビジュアライゼーションツールを使って、画像解析の可能性を最大限に引き出すことができます。ワンクリックで作成できるシームレスな解析パイプラインをご体験ください。互換性のあるワークステーションでは、大量のデータセットの処理も簡単です。ZEISSのVRツールキットを使用した没入感のある試料観察が、研究に新たな視点をもたらします。

ルーチンワークフローまたはカスタマイズされたワークフロー向けのクリック＆プレイソリューション
演算子を組み合わせて柔軟なパイプラインを実現
複数の画像ファイル形式に対応
コーディングなしでAIを活用し研究を強化
GPUを用いた3Dエンジンでビッグデータを可視化

ZEISS arivis Proソフトウェアの画面が表示されたデスクトップモニターを見ている、顕微鏡ラボで働く女性科学者。画面にはFIB-SEM体積電子顕微鏡データの核膜孔複合体の解析結果が表示されている。背景には2人の別の科学者がいる。

柔軟性の高いエンドツーエンドの画像解析パイプライン

ZEISS arivis Proは、画像解析パイプラインとビジュアライゼーションパイプラインの自動化をサポートします。従来の手法やAIモデルを駆使して、コーディングなしであらゆる画像サイズ、寸法、モダリティに対応するパイプラインを簡単に作成できます。

このソフトウェアは30以上の商用ファイル形式に対応し、大容量のファイルを簡単かつ効率的に処理します。事前設定されたパイプラインと標準的なアッセイは、単純な解析作業から高度な解析作業まで幅広く対応し、特定の目的に合わせてパイプラインをカスタマイズ可能です。

ワンクリックで解析を繰り返し、一貫性のある定量的な結果を得ることができます。生産性を高め、再現性のある結果を確実に得られるソリューションをご活用ください。

デモを申し込む

AIモデルを用いたFIB-SEM画像の細胞内構造の解析 — ご提供：Anna Steyer and Yannick Schwab, EMBL

高度な3D解析

複雑な作業においても、AIにより素早く結果が得られます。Zスタックのスライスをアノテーションしてモデルのセグメンテーションと分類をトレーニングし、それをデータセット全体に適用します。機械学習や深層学習の機能をローカルで使用するか、クラウド上でモデルをトレーニングし、それらをインポートして自動化パイプラインの中核を形成します。洗練された解析レポートに有用な3D視覚化やそのムービー作成などに、わずか数クリックでたどり着けます。

3Dオルガノイド解析 — 試料ご提供：Lutholf lab, imaging by Frank Vogler in the ZEISS customer center

ハイコンテントアナリシス

複雑な疾患の創薬では、2Dから4Dまで測定可能で、細胞や組織の表現型に対するより広い視野でのスクリーニングなど、高度な画像解析法が求められます。ZEISSのarivisソフトウェアをクラウドまたはローカルで使用してAIモデルをトレーニングし、画像解析を自動化することで、時間を節約し、人的バイアスを減らして、一貫性のある結果を取得できます。

トラッキングとリネージ

様々なサイズの2Dおよび3D画像データにおいて、細胞分裂や移動の表現型を定量し、その変化を追跡できます。ZEISS arivis Pro VRを使用すれば、臨場感あふれるVR環境において自動作成されたトラックの正確な校正が行えます。パイプラインは、さらに多くのデータセットに簡単に再適用可能です。

神経組織（マウス脳）の自動3Dニューロントレース。 — ご提供：Dr. Steffen Burgold, ZEISS RMS Customer Center Oberkochen, Germany

神経組織（マウス脳）の自動3Dニューロントレース。ご提供：Dr. Steffen Burgold, ZEISS RMS Customer Center Oberkochen, Germany — ご提供：Dr. Steffen Burgold, ZEISS RMS Customer Center Oberkochen, Germany

神経生物学

最先端のニューロントレーシング・アルゴリズムを採用したZEISS arivis Proでは、ワンクリックで多様な画像を自動的かつ繰り返し解析できます。低SNRであっても、ニューロン、グリア/ミクログリア細胞、軸索などを定量化し、半自動のインタラクティブツールやVRツールを用いてトレースを簡単に編集可能です。画像フォーマットを問わず、過去の実験データを解析できます。

ZEISS arivis Pro VR Toolkit

臨場感あふれるバーチャルリアリティ体験で、今までにない新たな視点で試料を捉えることができます。キーボードやマウスに縛られることなく、デジタル画像データを直接、移動、回転、拡大縮小、整形可能です。ZEISS arivis Pro VR Toolkitが、現実世界と同等の深い知覚体験へとあなたをいざないます。

試料を3Dで見る
多様な角度から細部を観察する
同僚と共同作業し、試料とその結果をライブで確認する
音声とハンズオンによる簡単操作
自動解析結果に対して、効果的でインタラクティブな校正と編集を行う

30以上の画像ファイル形式を変換

画像作成に使用した装置、形式、またはファイルサイズにかかわらず、ZEISS arivis SIS Converterは、ZEISS arivis Pro、arivis Pro VR、arivis Hubで画像を迅速かつインタラクティブに閲覧できるように、画像ファイルをScalable Image Storage（SIS）形式に簡単に変換できます。すべてのデータを保持しつつ、時間を大幅に節約しながら高度な解析が行えます。

30以上のファイル形式からの変換に対応
複数のインポートおよび変換タスクを実行
自動バッチ変換
使いやすいファイル変換タスク管理インターフェース
顕微鏡画像に限らず幅広く対応（CT、MRIなど）

対応画像ファイル形式

ブロックされたサードパーティーのコンテンツ

トラッキング設定により、ビデオプレーヤーがブロックされています。設定を変更してビデオを再生するには、以下のボタンをクリックして、「機能に関する」トラッキング技術の使用に同意してください。

ZEISS arivisソフトウェアは、顕微鏡画像解析において最先端のカスタマイズ性を提供します。

ZEISS arivis Pro 4.2では、ユーザーが自身のニーズに最適な画像解析手法を自由に選択できます。

最新版のリリースでは、強化されたAIベースのツール、3D解析機能、大規模データセット処理が追加されました。このソフトウェアによりこれまでにない柔軟性が実現し、顕微鏡画像解析ワークフローをカスタマイズして研究課題への答えを出すことができます。

この動画で最新機能の詳細をご覧ください。
drip cellpose

新機能

注目の新機能：

最適化されたメッシングとレンダリングにより、4D Viewerで無制限にオブジェクトを観察
ZEISS arivis Cloudでトレーニングした深層学習モデルによるインスタンス（オブジェクトベース）セグメンテーション

Cellpose演算を使用した顕微鏡画像における細胞および核のセグメンテーション
3Dイメージとして表示可能な解析パイプラインの高精度プレビューは、より有意義なプレビューを生成
オブジェクト作成操作（例：Neuron Tracer）において、解析パイプラインは4D Viewer内にプレビューを直接表示
機械学習は、使用する機能セットを自動的に最適化し、パフォーマンスを改善
オブジェクトテーブル内の膨大な数のオブジェクトの取り扱いを改善
ブランドを刷新：ソフトウェアの新名称がZEISS arivis Proに
シロイヌナズナの低温体積電子顕微鏡（Cryo-vEM）画像。試料ご提供：York-Dieter Stierhof, Tübingen University

2023年11月16日リリース arivis Vision4D 4.1.2の変更点

Cellpose Segmenter：

改善：メモリチェックを改善し、内部エラーを回避
改善：より明確なエラーと警告
改善：ヘルプで利用可能な事前にトレーニングされたモデルの説明の改善
変更：プレーンワイズ実行がデフォルトで有効に
修正：最初以外の時点の結果の取り扱い（ボクセルフィルターとの組み合わせ）
修正：最小強度値に偏りがあるデータのための正規化
修正：Cellpose Segmenterにおけるその他の小さな修正

インポート：

改善：XDCEデータのチャンネル名のインポート
修正：一部のND2時系列のインポートに関する問題

全般：

改善：アプリケーションの終了後に、消費されたライセンスがより迅速に使用可能に
事前にトレーニングされたcellpose aiモデルで検出されたニューロスフェア。

事前にトレーニングされたcellpose aiモデルで検出されたニューロスフェア。

事前にトレーニングされたcellpose aiモデルで検出されたニューロスフェア。

2023年7月25日リリース arivis Vision4D 4.1.1の変更点

注目の新機能：

Cellpose Segmenter - 解析パイプラインでの簡単かつ迅速なセグメンテーションのため、事前にトレーニングされたCellposeモデルを直接インポート

解析：

新機能：Cellpose Segmenterによるネイティブな解析操作（Python不要）
新機能：Deep Learning Trainerから作成したモデルをCZANNとしてエクスポート
改善：深層学習 - ZEISS ZENのN2Vモデルとの互換性向上
改善：DL Segmenterでは、デフォルトでAllow Holesオプションがオンに
改善：DLトレーニングの名前を変更する際の競合検証の改善
修正：スケール解析後のトラックの位置がまれに不正確になっていた問題を解決
修正：トレース中の細胞体のセグメント参照が間違っている可能性を解消

4D Viewer：

改善：4D Viewerでオブジェクトをダブルクリックする時の自動ズームがより使いやすく
修正：4D Viewerでトレース（コーン表示スタイル）が選択できない問題を解決

全般：

新機能：インストーラーでオプションコンポーネントの説明とオフラインダウンロードオプションを提供
修正：DeltaVision DVインポートの互換性向上
修正：更新後に開く新着情報の信頼性向上
修正：インストーラーが、以前のVision4Dバージョンのファイルがインストールフォルダに残っていないことを確認
arivis_dlライブラリに追加された小さな修正・改善
DLトレーニング操作

DLトレーニング操作

DLトレーニング操作

2023年3月27日リリース arivis Vision4D 4.1の変更点

注目の新機能：

新しいオプションモジュール：arivis AIツールキットに、Vision4D上で直接アノテーション追加、トレーニング、推論が可能な深層学習の完全なワークフローを追加
トレースワークフローの各種改善
ウェルまたはウェルのフィールドに画像セットを手動で割り当てるWellplate Editor

arivis AIツールキット：

新機能：オプションモジュールarivis AIツールキット
新機能：Deep Learning TrainerパネルでDLモデルのセットアップとトレーニングを実行
新機能：Draw Toolを使用して、クラスの領域にアノテーションを追加するためのセグメントを描画
新機能：スパースアノテーションの活用により、すべてのピクセルに描画する必要性を克服
新機能：描画されたオブジェクトをクラス順にソート - ピクセルを一番上のものに割り当て（重なりのカットは不要）
新機能：クラス定義のための既存のセグメントの追加と再利用
新機能：アノテーションがついたバックグランドに基づく自動クラスタリングが可能
新機能：Vision4Dから直接、DLトレーニングプロセスを実行およびモニタリング
新機能：解析パイプラインでトレーニングされたDLモデルを直接開いて推論
新機能：トレーニングされたDLモデルをONNXとしてエクスポート
新機能：DL Python環境全体をセットアップするための追加インストーラーパッケージ
ツール:

新機能：Draw Toolにコンテキストメニューを追加し、キーボードショートカットサポートを改善
新機能：DLトレーニングパネルを認識するDraw Tool
新機能：Draw Toolでは、ショートカットまたはコンテキストメニュー（DLトレーナーモード）で描画するクラスを変更可能
改善：Trace Tool - 細胞体セグメントに接続
改善：Trace Tool - 最適化された削除ブランチ
改善：Trace Toolの「接続できません」メッセージがより明確に

解析：

新機能：「Neuron Tracer」（セグメンテーションカテゴリー）を「Neurite Tracer」に名称変更
新機能：「Neuron Tracer」（Cell Body）を「Neuron Tracer」に名称変更
新機能：Neuron Tracerプレビューで、すべての部分を同じ色で表示
新機能：Neuron Tracerプレビューでは、フィルタリングされた部分が（完全に非表示になるのではなく）わずかに暗く表示される
改善：Neuron Tracerのパラメータラベルがより正確に
改善：Neuron Tracerのデフォルトしきい値としきい値警告
改善：Neuron Tracerのツールチップ
修正：追跡操作の結果が多い場合、最後のトラックが表示されない問題を解消
修正：Neuron Tracerで（ほぼ）空のトレースが作成される問題を解消
修正：プレビュー進捗ラベルがいつもすぐに表示されるように

ビジュアライゼーション：

新機能：トレースの始点の表示をオフにできる
改善：4D Viewerのトレースのコーン生成を最適化
改善：トレース用のコーンがメモリを超える場合、ラインベースのビジュアライゼーションにフォールバック
改善：2Dでのトレースビジュアライゼーションのために最後に使用されたZ投影値を記憶
修正：4D ViewerのRGB投影の軽微な問題を解決

データの取り扱い：

新機能：ウェルまたはウェルのフィールドに画像セットを手動で割り当てるWellplate Editor
新機能：画像セットの名前に基づいて、ウェルまたはフィールドの位置に画像セットを半自動的に割り当て（Wellplate Editor内）
新機能：ウェルを画像セットとしてインポートし、その後Wellplate Editorを開く追加インポートシナリオ（手動割り当て用）
修正：TileSorterでLaVisionデータが正しくインポートされない問題を解決
修正：TileSorter用にインポートした場合に一部のCZIで発生していた問題を解決

全般：

新機能：オプションインストールとしての予測分析サービス
新機能：gRPCサービスコネクター
新機能：ZenBridgeはgRPCサービスコネクターと連携可能（オプション）
改善：付属のSentinelドライバーとHASP Libをバージョン8.5にアップグレード
修正：ナビゲーターのフィールドセレクターのソート順（ウェルプレートデータ用）
修正：表面の変形ダイアログにおけるまれなクラッシュ
細かい追加修正および改善

Abberior Imspector（.obf、.msr）
AmiraMesh（*.am）
Aperio SVS（*.svs）
arivis Single Image Stack 3（*.sis）
BigDataViewerファイル形式（*.xml）
CompuServe GIF（*.gif、*.giff）
DeltaVision画像ファイル（*.dv）
DICOM Directory（*.dicomdir、*.DICOMDIR）
DICOM Image（*.dcm）
Fiji/ImageJ-TIFF（*.tif、*.tiff）
GE InCell（*.xdce）
Hamamatsu tiffと同様のファイル形式（*.ndpi）
ハイダイナミックレンジ画像（*.hdr）
ICS 1.0/2.0ファイル形式（*.ics、*.ibs）
Imaris IMS（*.ims）
Imspector（*.obf/*.msr）

JPEG/JFIF（*.jpg、*.jpeg、*.jif、*.jfif、*.j、*.jpe）
JPEG-2000（*.jp2、*.j2k、*.j2c）
Leica Image File Format（*.lei,*.lif）
Luxendo画像（BigDataViewer *.xmlとして保存）
Metamorph STK（*.stk）
Mirax SliceACファイル形式（*.mrxs）
Molecular Devices（GE IN Carta）
Neuroimaging Informatics Technology Initiative画像ファイル形式（*.hdr、*.nii、*.nii.gz）
Nikon ND2ファイル（*.nd2）
Olympusファイル形式（*.oir、*.oib、*.oif）
Olympus Media Handler（*.vsi）
OME-TIFF（*.tif、*.tiff）
OME-TIFF/FEI（*.tif、*.tiff）
OME-TIFF/LaVision（*.tif、*.tiff）
Perking Elmer PE（標準PE形式、.qptiff Columbusメタデータ）

Portable Network Graphics（*.png）
Slidebook（.sld） Media Handler
TIFF Tagged Image（*.tif、*.tim、*.tiff）
TillVisionファイル形式（*.rbinf、*.ini）
TrakEM2 Imageファイル形式（trakem2.xml、*.xml）
VGI/VOL Media Handler
VG Studio Max（*.vgl）
VG Studio Images VOL Media Handler（*.vol、*.vgi）
Virtual Microscopy Specimenファイル形式（*.vms、*.vmu）
Windows Bitmap（*.bmp、*.rle、*.vga、*.rl4、*.rl8、*.sys）
Zeiss Axiovision ZVI（*.zvi）
Zeiss CZI/ZISRAW（*.czi、*.zisraw）
Zeiss LSM-tiff（*.lsm）
Yokogawa CV（*.mlf）
Yokogawa CPf（*.mmd）
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ZEISS arivis software solutions for advanced image analysis

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