ZEN顕微鏡ソフトウェア

前バージョンで深層学習のトレーニング性能が最適化された後、今回のリリースではモデル採用の高速化が追加されました。メリット：

• Instance Segmentationの結果取得までの時間を短縮
• 画像解析ウィザード、Bio Apps、Guided Acquisitionワークフローでも、より高速な推論が可能に
  

Bio Appsツールキットのユーザーは、分子の核内輸送を解析できるようになりました。新しいメソッドには以下が含まれます。

• シンプルなワンステップ設定
• マルチウェルプレートのヒートマップを含む専用結果ビュー
• 高度な深層学習セグメンテーションを統合するオプション
  

Lattice SIM処理はDirect Processingの機能として実装されています。SIM²処理ワークフローを実行すると以下の利点が得られます。

• 結果取得までの時間短縮
• 専用解析処理ワークステーションでの並列処理による計算リソースの増加
• インテリジェントなデータ圧縮でファイル転送を高速化
  

ワイドフィールドモダリティでは、AIツールキットのユーザーは継続取得モードでNoise2Void深層学習を使用できるようになりました。これにより以下のことが可能になります。

• クラス最高のアルゴリズムによる効率的なライブノイズ除去
• サンプルに優しい照明設定下での高画質画像による試料観察
• 光毒性とフォトブリーチの軽減
  

インスタンス・セグメンテーション機能に重要なアップデートが行われ、セグメンテーションの質が向上し、結果取得までの時間が短縮されました：

• モデルトレーニング時間の大幅な削減
• ZEN画像解析機能でのマルチチャンネルインスタンス・セグメンテーションモデル
  
• 高密度の物体を可視化するランダムオブジェクト彩色
• インターネットアクセスが制限されているシステムのためのリモートモデルダウンロード
  

Zstdによる高速ロスレス圧縮が、ZENによる画像取得で標準採用になりました。

• 2倍～20倍の圧縮率により、高速ファイル転送とデータ保存コストの削減を実現します。
• 既存のデータアーカイブを簡単にまとめて圧縮する際には、無料のスタンドアローンツールCZI Shrinkをご利用ください。
  

今回のリリースでは、Direct Processingに以下の改善が加えられました：

• AIノイズ除去およびリニアアンミキシング（LSM Spectral Imaging用）をリモート解析専用ワークステーションで実行することで、取得システムの計算負荷を軽減します。
• Direct Processingは、LSMシステム付きCelldiscoverer 7のMixedモードでの画像撮影に対応しました。
  

ZEN Connectツールキットに追加された最新の機能により、相関イメージングのメリットが増えました：

• 今回のリリースでは、Dynamics ProfilerがConnectワークスペースに統合されます。
  
• マルチボリュームの3Dデータから、論文用のスクリーンショットを作成できます。
  

ZENの起動を簡素化
適切なプロファイルを利用したZENの起動が、さらに簡素化されました。ZENはこれまで、有効な（部分的に複雑な）ライセンスに基づいて構成されていましたが、現在では利用可能なMTB ZENプロファイルに直接アクセスして選択できるようになりました。

大容量データの処理をより迅速に
データセットのボリュームが増加の一途をたどる中、大規模データの取り扱いは依然として、顕微鏡ユーザーにとっての最重要テーマとなっています。ZSTD可逆圧縮を画像取得のデフォルトに設定できるようになったことで、ファイル転送速度が向上し、データ保存が最適化されました。さらに、最大輝度投影、タイルスティッチング、画像ピラミッド生成のアルゴリズムも大幅に高速化されています。

画像の前処理の高速化および自動化
大好評のワークフローツールDirect Processingに、また新たなツールセットが加わりました。ZEN 3.8では、自動取得ワークフローにスティッチングを直接組み込めると同時に、アルゴリズムの最適化と並列処理によるパフォーマンス向上のメリットを得ることができます。

さらに進化したセグメンテーション
Instanceセグメンテーションは現在、arivis AIクラウドプラットフォーム上での注釈付けおよびトレーニングが可能です。ZENでは、画像解析ウィザードとBio Appsツールキットを使用して、この新しいAI機能をワークフローに組み込むことができます。Instanceセグメンテーションを使えば、エラーが発生しやすく制約のある分水嶺アルゴリズムに頼ることなく、互いに近接したオブジェクトであっても正確に分離することができます。

利用モデルの柔軟性が高まり、ワークステーションリソースの有効活用が実現
ZENとそのツールキットパッケージにフローティングライセンスが導入されたことにより、施設における利用の幅が広がります。これまでZENユーザーは特定のワークステーションに制限されていましたが、その制限がなくなり、インフラリソースをより柔軟に利用できるようになりました。

イメージングシステムの潜在能力をすべて活用
高度なイメージングシステムの取得速度は、データ保存速度をはるかに上回るため、大規模なデータ実験には限界があります。そこでZEISSは、ZENにロスレスで高速なZstandard圧縮を搭載しました。これにより、最大20倍の圧縮率でデータ保存を高速化し、データエコノミーを最適化することができます。Zstandardは、Direct ProcessingモジュールとZEISS Lattice Lightsheet 7システムの両方に内蔵されています。また、.czi形式であれば、あらゆるデータにオプションで利用可能です。

Guided Acquisitionワークフローの改善
Guided Acquisitionモジュールには、より複雑なSmart Imagingワークフローも実行可能な新機能が追加されました。画像解析ウィザードに充実したクラス選択が加わり、どの程度詳細な取得を行うかを細かく調整できるようになりました。

オープンモデル構造でモデル交換が可能に
画像解析ソフトウェアでは、深層学習ツールをどこでも利用できるようになりました。ZEISSのソフトウェアポートフォリオも例外ではありません。シンプルなモデル交換をサポートするために、ZENとVision4DはAPEERの深層学習およびサードパーティーモデルの互換性を有しています。確立されたワークフローにおいて、お好きなモデルを無料で適用いただけます。