ZENソフトウェアツールキット

2Dツールキット

ライフサイエンス研究における基本画像解析

2Dツールキットを使用することで、試料の正確な解析が可能になります。使いやすいウィザードによりセットアップが容易で、プロセスを完全に制御しながら、タスクを効率的かつ簡単に完了できます。

最小限の専門知識で本格的な画像解析が可能に
クラス、パラメータ、機能を柔軟に微調整
従来のセグメンテーションアルゴリズムとAIベースのセグメンテーションアルゴリズムから選択可能
見やすくインタラクティブな解析結果

最小限の専門知識で本格的な画像解析が可能に

優れた結果を導き出す便利なガイダンス

画像解析はしばしば複雑ですが、難しく考える必要はありません。画像解析ウィザードに従って順に解析設定を行います。関心のあるクラスを定義し、セグメンテーション方法と抽出する特徴を選択するといった操作はすべて数分以内に実行可能です。解析スクリプトを作成した後は、解析を実行して次に進むことも、他のデータセットに再利用して再現性のある結果を生成することもできます。

クラス、パラメータ、機能を柔軟に微調整

個々の解析固有の課題に応える

最適な画像解析には微調整が必要ですが、それは画質や試料の複雑さ、あるいは科学的な疑問によって異なります。画像解析ウィザードでは、入れ子の可能性のある複数のクラスの設定や低画質画像の前処理、多様なセグメンテーション法の選択、（データ抽出用）多様な測定機能の選択、さらには独自の測定設定が可能です。

従来のセグメンテーションアルゴリズムとAIベースのセグメンテーションアルゴリズムから選択可能

可能性を広げる

画像解析の核であるセグメンテーションは、視覚的な特性に基づいてオブジェクトを正確に識別する技術です。考えられるあらゆるバリエーションと複雑さをカバーするために、画像解析ウィザードには、輝度閾値、分散ベース、動的セグメンテーションなどのオプションが用意されています。同様に、ウィザードは、例えばarivis CloudからインポートされたIntellesis機械学習および深層学習のセグメンテーションモデルと互換性があります。

見やすくインタラクティブな解析結果

研究に役立つ成果

解析が完了すると、視覚的なオーバーレイ、設定可能なプロット、エクスポート可能なデータテーブルが表示されます。統計は、試料レベルと単一オブジェクトレベルの両方で提供されます。プロット機能により、任意の特徴をヒストグラム、散布図、ヒートマップとして表示することができ、これは特にウェルプレートスクリーンに有用です。すべてのデータは相互にリンクされているので、あらゆる実験観察をインタラクティブに探索できます。

画像解析ウィザードの詳細

柔軟なクラス定義ウィザードにより、複数のオブジェクトクラスを定義することができます。また、複雑に入れ子になったクラス階層（「オブジェクトの中のオブジェクト」）も簡単にモデリングできます。

前処理と後処理画像解析ウィザードは、セグメンテーションの前に画像の前処理（画像のスムージング、シャープネス、背景の減算など）を行えます。形態フィルタまたはオブジェクト分割操作で、セグメンテーションの結果を編集します。

オブジェクトの柔軟なフィルタリングフィルタリングによってセグメンテーション結果をさらに絞り込みます。本ウィザードは、オブジェクトの特徴を任意の組み合わせでフィルタリングを行い、選択されたオブジェクトと解除されたオブジェクトのプレビューを表示できます。

特徴と注釈本ウィザードは、解析に適した、必要なオブジェクトの特徴を正確に選択でき、結果に表示される注釈をカスタマイズできます。

カスタム機能画像解析ウィザードでカスタム機能を定義し、2つ以上の基本機能（比率、製品など）の組み合わせを計算できます。単一オブジェクト統計とアンサンブル統計が含まれています。
バイナリ画像の分割このセグメンターを使用して、インポートしたバイナリ画像マスク（外部解析など）を解析用のZENオブジェクトに変換します。オブジェクトのサイズフィルタリングとオブジェクトの分割も利用可能です。

Zones Of Influence（ZOI） ZOIは、オブジェクトの周囲を解析できる特別なセグメンテーション法です。これにより、細胞シグナル分子の核内移行など、特定の細胞領域の解析が可能になります。

機械学習セグメンター画像解析ウィザードは、AIツールキットで利用可能な機械学習セグメンテーションを統合可能です。強力な機械学習アルゴリズムは、従来のアルゴリズムでは解決できなかったセグメンテーションの問題を解決します。

深層学習セグメンター深層学習に基づくセマンティックセグメンテーションやインスタンスセグメンテーションは非常に強力なメソッドです。本ウィザードは、arivis Cloudまたはサードパーティ製ツールで学習されたモデルと互換性があります。

3Dセグメンテーション 3Dツールキットと組み合わせることで、本ウィザードは輝度ベースの閾値セグメンテーションから3Dオブジェクトを生成します。その上、3DセグメンテーションはAIツールキットやarivis CloudのAIベースのモデルと互換性があります。

処理機能

あらゆる状況に対応する便利な機能

本ツールキットは、標準的な幾何学的、形態学的、画像の平滑化と先鋭化、またはバイナリ操作をカバーする170を超える単一画像処理機能だけでなく、セグメンテーションやIntellesis機能のような高度な機能も備えています。ほぼすべてがマクロプログラミングに対応し、30以上が自動化のためのバッチ処理に対応しています。