Connect Toolkit - ライフサイエンス研究におけるシームレスな相関イメージング体験
ZENソフトウェアツールキット

Connect Toolkit ライフサイエンスにおける相関イメージング体験

多目的な相関イメージングに最適なConnect Toolkitでは、ZEISSイメージングシステムでのマルチモーダル画像取得が可能であるとともに、直感的な位置合わせ・登録ツールが利用できます。便利な機能を活用し、試料の全体像を把握しましょう。

  • 簡単な試料ナビゲーション
  • スマートなデータ整理
  • マルチスケールの視点で新たな洞察を得る

ZEN Connect Toolkitについて詳しく見る

ZEN Connect Toolkitでライフサイエンスにおける相関ワークフローが革新的に変化する様子を1分未満の動画でご覧ください。

サファイヤディスク上にプランジ凍結された腺がん細胞。ZEN Connectでは、すべての関心領域がコンテキストで表示されます。

サファイヤディスク上にプランジ凍結された腺がん細胞。ZEN Connectでは、すべての関心領域がコンテキストで表示されます。

サファイヤディスク上にプランジ凍結された腺がん細胞。ZEN Connectでは、すべての関心領域がコンテキストで表示されます。

マルチスケールの視点で新たな洞察を得る

様々なスケールのマルチモーダルな視点で新たな洞察が明らかに

相関顕微鏡法は、試料に関する比類ない洞察をもたらします。Connect Toolkitは、光学顕微鏡や電子顕微鏡を活用し、標準的なサンプルホルダー用に事前に定めた設定、ステージの位置合わせのための正確なキャリブレーション、様々なスケールのイメージングデータを表示する機能により、こうした実験をサポートします。Connect Toolkitを使用することで、イメージング体験を向上させ、試料に対する包括的な理解を深めることができます。

ZEISS ZEN Connect上の相関クライオデータセット

ZEISS ZEN Connect上の相関クライオデータセット

ZEISS ZEN Connect上の相関クライオデータセット

簡単な試料ナビゲーション

撮影中に全体像をしっかり把握

イメージング実験では、広い視野を保つことが常に有益です。相関ビューアは、試料の関連するすべての部分のオーバービュー画像を表示し、ガイド付きナビゲーションを提供します。詳細な画像取得の際、ビューアを使用してステージを簡単かつ迅速に、関心のあるすべての試料部分に移動させることができます。 

自動スライドスキャンとZEISSの他の顕微鏡システムでの詳細調査をZEN Connectプロジェクトで組み合わせる

自動スライドスキャンとZEISSの他の顕微鏡システムでの詳細調査をZEN Connectプロジェクトで組み合わせる

自動スライドスキャンとZEISSの他の顕微鏡システムでの詳細調査をZEN Connectプロジェクトで組み合わせる

スマートなデータ整理

すべてのデータを1ヶ所にまとめる 

Connect Toolkitは、データをスマートに整理するのに役立ちます。フォルダの中に大量の画像ファイルがある煩雑さにお悩みではありませんか?データを手作業で整理する手間や、ファイルへのアクセスしにくさに悩む必要はもうありません。Connect Toolkitを使えば、包括的なデータコンテナの中で、すべての画像をコンテキスト上で維持することができます。使いやすいナビゲーションにより、Connect Toolkit内で直接ワンクリックするだけで、一つひとつの画像にアクセス可能です。

Connect Toolkitのキャリブレーション・位置合わせ法

相関顕微鏡法には複数のモダリティが用いられ、各モダリティは通常、ステージのキャリブレーションや位置合わせを必要とします。Connect Toolkitには、撮影前後の試料位置決めのためのいくつかの方法が備わっており、最適なイメージング結果を得るのに役立ちます。次のセクションでは、利用可能な方法の概要を説明します。

2D位置合わせ

  • 位置合わせ

    位置合わせ

    基本的な位置合わせ:相関ビューアでの画像セットの移動・回転・拡大縮小・せん断。低解像度のオーバービュー画像に高解像度の画像を視覚的に位置合わせできます。

  • 手動アライメントウィザード

    手動アライメントウィザード

    基本的な位置合わせと内容は同じですが、専用のウィザードが付いています。平行移動・回転・スケーリング・せん断の値を数値で入力できます。

  • ポイントアライメントウィザード

    ポイントアライメントウィザード

    分割ビューを使用して、位置を定義するための基準点を設定します。少なくとも3つの明確な対応点を持つ画像を平行移動・回転・拡大縮小できます。

3D位置合わせ

  • 3D位置合わせ

    3D位置合わせ

    カメラのパースペクティブの問題に対処し、位置合わせのずれた相関画像で3Dデータセットを3D回転するためのアドオン。

  • 3Dポイントアライメントウィザード

    3Dポイントアライメントウィザード

    3Dデータセット内の任意の位置に基準点を描画します。アルゴリズムが平行移動とx-y回転を実行します。

  • 3Dで二つの画像をそろえる

    3Dで二つの画像をそろえる

    Tomo3Dビューアにおいて、任意の3D平面上で2つの3Dスタックを平行移動させることができます。これには3Dツールキットが必要です。

ステージキャリブレーション

  • システムの調整

    システムの調整

    標準的な位置合わせとは異なり、この方法ではステージの再キャリブレーションも行います。システムのキャリブレーションにはカスタム基準点を使用します。

  • Shuttle & Find

    Shuttle & Find

    基準点が固定されたサンプルホルダーと組み合わせて使用します。基準点は、ステージの位置、スケール、カメラアングルを調整するのに役立ちます。

Connect BaseとConnect Toolkitの比較

ZEN Connect Baseでは、基本的な相関機能の一部をご利用いただけます。一方、Connect Toolkitは既存のすべての相関機能を提供します。以下の表は、Connect BaseとConnect Toolkitの機能を比較したものです。

Connect Base
Connect Toolkit

相関ビューア/プロジェクト

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位置合わせ/システムの調整

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キャリブレーション済みステージの自動登録

x

x

CZI画像取得/インポート

x

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ビューアからのステージ制御

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3Dで二つの画像をそろえる

3Dツールキットが必要

3Dツールキットが必要

相関ビューアでの測定

x

領域の定義と取得(セカンドシステム上)

x

Shuttle & Find

x

アライメントウィザード/3D(Z軸方向)アライメント

x

バイオフォーマットとFIBスタック画像のインポート

x

拡張画像/動画エクスポート(プロジェクトビュー、SerialEM)

x

Connect Toolkitポイントアライメント

試料上の点を簡単に揃える

ダウンロード

  • ZEISS ZEN Connect

    Overlay and Organize Images From Any Source to Connect Your Multimodal Data

    2 MB


利用可能な翻訳およびその他のマニュアルについては、 ZEISSダウンロードセンター をご覧ください。

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