ZENソフトウェアツールキット

開発ツールキット

ライフサイエンス分野でのソフトウェアの統合とカスタマイズ

近年、画像実験では、付属のコネクテッドデバイスを必要とすることが増えています。ワークフローによっては、FIJIやPythonで利用できるものの、ZENでは利用できない高度な機能が必要になる場合もあります。ZEN開発ツールキットを使用すれば、外部ツールをZENに、またはZENを外部ツールにスムーズに統合して、実験の自動化の可能性をさらに広げることができます。

数多くの多様なインターフェース
IDEを統合したスクリプトインターフェース
外部ソフトウェアによる装置制御

数多くの多様なインターフェース

様々な方法で装置にアクセス可能

装置の制御を含むZENに外部ツールからアクセスするには、さまざまな方法があります。OAD（オープンアプリケーション開発）により、FIJIやPythonなどでワークフローのカスタマイズ、自動化、外部解析の実行が可能になります。また、TCP/IPインターフェースにより、外部アプリケーションから装置を遠隔制御することができます。ZENの拡張機能を使用すれば、高度なアプリケーション開発が可能になります。

IDEを統合したスクリプトインターフェース

ZEN独自のスクリプトツールにより、ワークフローを丸ごとカスタマイズ

ZEN開発ツールキットの心臓部は、IronPythonのスクリプティングのための統合開発環境（IDE）です。IDEを使用すれば、IronPythonのパッケージおよび.NETのライブラリのインポートが可能になります。このIDEは軽量で、ZENでの手動ワークフローの記録、IntelliSenseのコード補完を用いたコード編集、デバッギングを行うことができます。ZENのハードウェア制御や解析機能がほぼすべて使用でき、スクリプトを用いて外部解析ソフトウェアを実行することも可能です。

外部ソフトウェアを通じた装置制御

ZENの遠隔制御を通じてワークフローを丸ごとカスタマイズ

カスタマイズ済みワークフローにイメージングを統合する場合、外部ソフトウェアを使えば、ZENを容易に遠隔制御することができます。ZENには使いやすいTCP-IPインターフェースとCOMインターフェースが実装されており、外部からのZEN PythonScriptコマンドの受取りを可能にします。つまり、簡単に個々のコマンドを送ったり、間接的な負荷を最小限にしてOADマクロ全体を送ったりできるのです。

ZENマクロIDE - 機能とテンプレート

コード補完
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トラッキング設定により、ビデオプレーヤーがブロックされています。設定を変更してビデオを再生するには、以下のボタンをクリックして、「機能に関する」トラッキング技術の使用に同意してください。

マクロエディタのコード補完により、オブジェクト変数や方法を提案したりタイプミスを減らしたりできるため、スクリプトのコーディングが高速化します。

コード補完

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マクロでイメージングワークフローを自動化しカスタマイズすることにより、イメージングシステム上でハードウェアパラメータへのアクセスが付与され、パラメータを制御できます。

ハードウェア制御

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マクロで画像処理のワークフローを自動化しカスタマイズします。画像解析、BioApps、Intellesisなど、ZENのほぼすべての機能にアクセスできます。

処理と画像解析

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ZENのAPIでユーザーが入力するインタラクティブなスクリプトを作成します。テキストフィールド、ドロップダウンメニュー、UI要素から、実験パラメータを定義したり、アクセスしたりできます。

シンプルなGUI作成
IronPythonの機能

外部アプリケーションの実行

ZENにプロットをインポート

マクロの統合
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ZENのマクロエディタは.NETスクリプティングのためにIronPython で構築されており、CPython 2.7および.NETアセンブリと互換性があるため、複雑なマクロの作成が可能です。

IronPythonの機能

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ZENのマクロエディタを使えば、ほんの数行のコードで外部ソフトウェアから画像処理を統合できます。

外部アプリケーションの実行

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外部からプロットやグラフを再インポートすれば、ワークフローのカスタマイズが簡単になります。ZENはPNGやJPEGなどのよく使われるデータ形式を読み取ることができます。

ZENにプロットをインポート

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新しいマクロをZENのUIに連携させて、いつでも使えるようにすることができます。マクロは、クリック可能なボタンとして画像ビュアーの上のパネルに表示されます。

マクロの統合