软件

蔡司arivis Pro

高级图像分析和可视化解决方案

利用我们强大的图像分析和可视化工具充分发挥成像潜力。您只需点击几下，即可创建无缝分析流程，并在兼容的工作站上轻松处理大量数据集。使用我们的VR Toolkit“走进样品”，获得全新视角。

用于常规或定制工作流的即点即用型解决方案
整合各类操作用于灵活的流程
兼容多种成像文件格式
使用无需编码的人工智能促进研究
通过GPU驱动的三维引擎对大数据进行可视化处理

一位女科学家正在显微镜实验室中工作，桌面显示器显示蔡司arivis Pro软件的屏幕，其中包含聚焦离子束扫描电子显微镜体电镜数据核孔复合体的分析结果。背景中有另外两位科学家。

灵活的端到端图像分析流程

蔡司arivis Pro助您实现自动化的图像分析和可视化流程。借助传统方式或人工智能模型，无需编写代码，即可轻松创建适用于各种图像尺寸、维度或模式的流程。

该软件支持并精于处理超过30种商业文件格式，即便面对大型文件，依然轻松高效。针对简单或复杂的分析任务，可提供预设置的流程和标准的分析方案，同时支持为特定目标定制专属流程。

只需轻松一键，即可重复分析，获得准确稳定的定量结果。该软件助您提高效率，并确保获得可重复的结果。

申请演示

基于聚焦离子束扫描电子显微镜图像人工智能模型的亚细胞分析 — 由欧洲分子生物学实验室的Anna Steyer和Yannick Schwab提供。

高级三维分析

即使面对复杂任务，也可借助人工智能快速获取结果。您可以通过在Z轴序列图像中的某一层进行标注来训练模型分割和分类，并将其应用于整个数据集。在本地使用机器学习和深度学习运算符，或在云端训练模型，然后将其导入以形成自动化流程的核心。只需点击几下，即能以三维方式显示结果或创建视频，生成出色的分析报告。

三维类器官分析 — 样品由Lutholf实验室提供，由蔡司客户中心的Frank Vogler进行成像

高内涵分析

为深入研究复杂的抗病药物，需要采用先进的图像分析方法，例如针对更广泛的细胞或组织表型进行筛选，逐步从二维扩展至四维。使用蔡司arivis软件，您可以在云端或本地训练人工智能模型，同时自动进行图像分析以节省时间、减少人为偏差并获得准确稳定的结果。

追踪和谱系

对细胞分裂和迁移表型进行量化，可追踪任意尺寸的二维及三维图像集的动态变化。蔡司arivis Pro VR助您在沉浸式VR环境中准确校对自动生成的追踪信息，轻松将流程重新应用于更多数据集。

神经元组织（小鼠大脑）的自动三维神经元追踪。 — 由德国奥伯科亨蔡司研究显微镜解决方案业务部门客户中心的Steffen Burgold博士提供。

神经元组织（小鼠大脑）的自动三维神经元追踪。由德国奥伯科亨蔡司研究显微镜解决方案业务部门客户中心的Steffen Burgold博士提供。 — 由德国奥伯科亨蔡司研究显微镜解决方案业务部门客户中心的Steffen Burgold博士提供。

神经生物学

使用先进的神经元追踪算法，只需点击一下，即可对各类图像进行自动、可重复的分析。即使信噪比（SNR）较低，依然能对神经元、胶质细胞/小胶质细胞和轴突等进行量化。使用我们的半自动交互式VR工具，轻松编辑追踪信息，无论图像格式如何，均可分析过去的实验数据。

蔡司arivis Pro VR Toolkit

借助沉浸式虚拟现实体验，用全新视角观察样品。您可以直接移动、旋转、缩放和塑造您的数字图像数据，不受键盘和鼠标的束缚。体验可与现实世界相媲美的深度感知。

以三维形式探索样品
多角度观察细节
与同事协作，实时查看样品和结果
轻松进行语音和手动控制
对自动分析结果进行有效的交互式校对和编辑

转换30多种图像文件格式

无论您通过什么设备创建图像，无论使用何种格式或文件大小如何：蔡司arivis SIS转换器均可轻松将您的图像文件转换为可扩展图像存储（SIS）格式，以便使用蔡司arivis Pro、arivis Pro VR和arivis Hub快速、交互式地探索您的图像。您可以节省大量时间，同时保留所有数据以进行高级分析。

支持30多种格式的文件转换
对多个导入和转换任务进行队列排序
无人值守的批量转换
易于使用的文件转换任务管理界面
还可处理除显微镜图像外的其他图像（如CT、MRI）

支持的图像文件格式

第三方内容被阻止

由于您的跟踪首选项，视频播放器已被阻止。要更改设置并播放视频，请点击下方按钮并同意使用“功能”跟踪技术。

用户定制是通过蔡司arivis软件进行显微镜图像分析的重中之重

蔡司arivis Pro 4.2让用户可以自由选择适合其需求的图像分析方法。

新版本包括增强的人工智能驱动工具、三维分析功能和大型数据集处理。该软件十分灵活，可量身打造显微镜图像分析工作流，助您为研究问题寻找答案。

观看本短视频了解更多关于新功能的内容。
drip cellpose

所含内容

新功能和重要内容：

优化网格划分和渲染，可在4D Viewer中处理不限量的对象
由在蔡司arivis Cloud上训练的深度学习模型驱动实例（基于对象）分割

使用Cellpose操作对显微镜图像中的细胞和细胞核进行分割
分析流程中的高精度预览可处理三维数据，生成更有意义的预览效果
分析可直接在4D Viewer中显示对象创建操作的预览（例如Neuron Tracer）
机器学习可自动优化使用的功能集（以提高性能）
改进了对对象表中大量对象的处理
已完成品牌重塑：软件现命名为蔡司arivis Pro
拟南芥低温体电镜（Cryo-vEM）样品，由图宾根大学的York-Dieter Stierhof提供。

arivis Vision4D 4.1.2的变更总结发布于2023年11月16日

Cellpose分割器：

改进：更好的内存检查以避免内部错误
改进：更清晰的错误和警告信息
改进：在帮助中更好地描述可用的预训练模型
变更：现默认启用“逐平面进行”功能
修复：处理第一个时间点以外的其他时间点的结果（与体素过滤器相结合）
修复：对最小强度值存在偏差的数据进行归一化处理
修复：对Cellpose分割器的其他小修复

导入：

改进：为XDCE数据导入通道名称
修复：部分ND2时间序列的导入问题

总体：

改进：退出应用程序后可更快地释放已占用的许可证
使用预先训练的cellpose人工智能模型检测神经球。

使用预先训练的cellpose人工智能模型检测神经球。

使用预先训练的cellpose人工智能模型检测神经球。

arivis Vision4D 4.1.1的变更总结
发布于2023年7月25日

新功能和重要内容：

Cellpose分割器：直接导入预先训练的Cellpose模型，以便在分析流程中轻松快速地进行分割

分析：

新功能：本地Cellpose分割器分析操作（无需Python）
新功能：将深度学习训练器创建的模型导出为CZANN
改进：深度学习：更好地兼容蔡司ZEN的N2V模型
改进：深度学习分割器的Allow Holes选项默认为打开
改进：重命名深度学习训练时更好的冲突验证
修复：缩放分析后轨道位置偶尔不正确的情况
修复：追踪中细胞体的片段参考可能存在错误

4D Viewer：

改进：在4D Viewer中双击对象时自动缩放功能更实用
修复：在4D Viewer中有时无法选择轨迹（锥形显示样式）

总体：

新功能：在安装程序中为可选组件提供说明和离线下载
修复：改进了DeltaVision DV导入的兼容性
修复：更新后打开“新功能”更可靠
修复：安装程序可确保安装文件夹中不遗留Vision4D旧版本的文件
对arivis_dl库的其他小修复和改进
深度学习训练操作

深度学习训练操作

深度学习训练操作

arivis Vision4D 4.1的变更总结
发布于2023年3月27日

新功能和重要内容：

全新可选模块：arivis AI toolkit可在Vision4D中实现完整的深度学习工作流——注释、训练和推理
追踪工作流的各种改进
孔板编辑器可手动将图像集分配给孔或孔的区域

arivis AI toolkit：

新功能：可选模块arivis AI toolkit
新功能：深度学习训练器面板，用于设置和训练深度学习模型
新功能：使用绘图工具绘制线段以注释类别区域
新功能：利用稀疏注释来避免每个像素都需要绘制
新功能：绘制的对象按类别顺序排序——像素分配给最上方的对象（无需剪切重叠部分）
新功能：添加和重用现有分段以定义类别
新功能：可根据注释的背景信息自动聚类
新功能：从Vision4D直接运行和监控深度学习训练过程
新功能：在分析流程中直接打开训练好的深度学习模型进行推理
新功能：将训练好的深度学习模型导出为ONNX
新功能：附加安装程序包，用于设置整个深度学习Python环境
工具：

新功能：绘图工具包含上下文菜单，并能更好地支持键盘快捷键
新功能：绘图工具可识别深度学习训练面板
新功能：绘图工具允许通过快捷键或上下文菜单（在深度学习训练模式下）更改绘图类别
改进：追踪工具——连接至细胞体片段
改进：追踪工具——优化了删除分支功能
改进：追踪工具中的“无法连接”信息更易于理解

分析：

新功能：“Neuron Tracer”（来自分割类别）已更名为“Neurite Tracer”
新功能：“Neuron Tracer”（来自细胞体）已更名为“Neuron Tracer”
新功能：Neuron Tracer预览以相同颜色显示所有部分
新功能：Neuron Tracer预览显示的过滤部分略微变暗（而非完全隐藏）
改进：Neuron Tracer中的参数标记更加准确
改进：Neuron Tracer中的默认阈值和阈值警告
改进：Neuron Tracer中的提示文本
修复：如追踪操作有大量结果，可能会导致最后追踪不显示
修复：防止在Neuron Tracer中创建（几乎为）空的追踪
修复：确保始终立即显示预览进度标记

可视化：

新功能：可关闭追踪起点显示
改进：优化了4D Viewer中追踪的锥形生成
改进：如追踪锥形超出内存，则回退到基于线条的可视化
改进：在二维追踪可视化中记忆上次使用的Z投影值
修复：4D Viewer中RGB投影的小问题

数据处理：

新功能：孔板编辑器可手动将图像集分配给孔或孔的区域
新功能：根据图像集的名称（在孔板编辑器中）半自动地将图像集分配到孔或区域位置
新功能：新增导入方案，可将孔作为图像集导入，然后打开孔板编辑器（用于手动分配）
修复：无法为TileSorter正确导入某些LaVision数据
修复：为TileSorter导入时部分CZI出现问题

总体：

新功能：可选择安装预测分析服务
新功能：gRPC服务连接器
新功能：ZenBridge可与gRPC服务连接器配合使用（可选）
改进：包含的Sentinel驱动程序和HASP Lib已升级至8.5版本
修复：导航器字段选择器中的排序（用于孔板数据）
修复：“变换曲面”对话框中偶发的崩溃问题
其他小修复和改进

Abberior Imspector (.obf, .msr)
AmiraMesh (*.am)
Aperio SVS (*.svs)
arivis Single Image Stack 3 (*.sis)
BigDataViewer文件格式 (*.xml)
CompuServe GIF (*.gif, *.giff)
DeltaVision图像文件 (*.dv)
DICOM Directory (*.dicomdir, *.DICOMDIR)
DICOM Image (*.dcm)
Fiji/ImageJ-TIFF (*.tif, *.tiff)
GE InCell (*.xdce)
Hamamatsu tiff类文件格式 (*.ndpi)
High Dynamic Range Image (*.hdr)
ICS 1.0/2.0文件格式 (*.ics, *.ibs)
Imaris IMS (*.ims)
Imspector (*.obf/*.msr)

JPEG/JFIF (*.jpg, *.jpeg, *.jif, *.jfif, *.j, *.jpe)
JPEG-2000 (*.jp2, *.j2k, *.j2c)
Leica图像文件格式 (*.lei,*.lif)
Luxendo图像 (保存为BigDataViewer *.xml)
Metamorph STK (*.stk)
Mirax SliceAC文件格式 (*.mrxs)
Molecular Devices (GE IN Carta)
Neuroimaging Informatics Technology Initiative图像文件格式 (*.hdr, *.nii, *.nii.gz)
Nikon ND2文件 (*.nd2)
Olympus文件格式 (*.oir, *.oib, *.oif)
Olympus Media Handler (*.vsi)
OME-TIFF (*.tif, *.tiff)
OME-TIFF/FEI (*.tif, *.tiff)
OME-TIFF/LaVision (*.tif, *.tiff)
Perking Elmer PE (标准PE格式, .qptiff Columbus元数据)

Portable Network Graphics (*.png)
Slidebook (.sld) Media Handler
TIFF标签图像 (*.tif, *.tim, *.tiff)
TillVision文件格式 (*.rbinf, *.ini)
TrakEM2 Image文件格式 (trakem2.xml, *.xml)
VGI/VOL Media Handler
VG Studio Max (*.vgl)
VG Studio Images VOL Media Handler (*.vol, *.vgi)
Virtual Microscopy Specimen文件格式 (*.vms, *.vmu)
Windows Bitmap (*.bmp, *.rle, *.vga, *.rl4, *.rl8, *.sys)
蔡司Axiovision ZVI (*.zvi)
蔡司CZI/ZISRAW (*.czi, *.zisraw)
蔡司LSM-tiff (*.lsm)
Yokogawa CV (*.mlf)
Yokogawa CPf (*.mmd)
下载SIS转换器

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ZEISS arivis product family information

ZEISS arivis software solutions for advanced image analysis

6 MB

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ZEISS Solutions for Semiconductor Development, Manufacturing, and Analysis

Accelerating Digital Transformation and Innovation for Semiconductor Electronics

13 MB

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