分子定量工具包套装图示
ZEN软件工具包

分子定量工具包(Molecular Quantification Toolkit)

研究运动中的生命

蔡司成像系统可进行光漂白、光活化或比率成像实验。该工具包提供了获取和分析此类实验的高级功能,包括用于荧光漂白后恢复(FRAP)、福斯特共振能量转移(FRET)和比率分析的专用用户界面。

  • 高像素精度的光操作
  • 向导式分析和可视化
  • 工作流定制和自动化
图像由德国雷根斯堡药物生物学研究所的Birgit Kraus提供。

高像素精度的光操作

成功进行光漂白实验的前提条件

光漂白和光活化实验需要准确定义待处理的细胞器或凝聚物的细胞区室。ZEN分子定量工具包可助您通过手动或自动分析,轻松配置感兴趣区域,并将其分为漂白或对照区域。在共聚焦系统的激光技术支持下,能够以十分有效的波长和强度逐像素定位这些区域。

向导式分析和可视化

向导式分析和可视化

复杂分析变得简单直观

分子动力学实验涉及复杂的分析,需要整合参考区域、图像或进行指数曲线拟合。该工具包为光操作应用提供向导式分析,如FRAP中一阶或二阶动力学的扩散常数、FRET效率计算的所有典型方法以及灵活的比率分析。此外,它还提供了多种方式以精美呈现可视化结果。

图像由美国纽约康奈尔大学威尔医学院Randi Silver博士实验室的Roberto Levi博士提供。

工作流定制和自动化

充分发挥动力学实验的潜力

该工具包还提供不同层次的定制和自动化功能。您可以实时修改帧率等采集参数,以捕获快速动力学。漂白方案可在强度、波长或驻留时间方面进行优化,以找到适合各个荧光基团的理想条件。在确定理想参数后,便能够继续对任意数量的区域和图像场景进行全自动漂白实验。

FRAP是什么?

FRAP原理

FRAP原理

通过光漂白揭秘分子动力学

荧光漂白后恢复(FRAP)方法用于研究荧光分子的迁移率。荧光基团在小区域内不可逆地失活。通过附近荧光分子与该区域的交换速率,可以确定扩散速率以及结合和未结合分子的数量。

FRAP变体

FRAP变体

光漂白方法及其使用时机

除标准FRAP外,还有多种相关方法可供使用。反向FRAP(iFRAP)和“光漂白中的荧光损失”(FLIP)有助于确定某一区域(如细胞器)是否与其环境积极交换或孤立;而通过“光漂白后荧光定位”(FLAP),可以精准确定目标分子的空间位置。该工具包支持所有这些方法。

FRET是什么?

FRET简介
FRET简介

FRET简介

物理原理与分子设计

FRET利用了福斯特共振能量转移的物理原理进行测量,即两个非常接近(< 10 nm)的匹配荧光基团之间的能量转移。这一方法揭示了蛋白质动态结合或解离的精准细节。

受体光漂白方法

受体光漂白方法

轻松实现福斯特能量转移

该工具包为两种主要的FRET方法提供了专门的工作流,其中之一是受体光漂白。在该方法中,感兴趣区域的受体通道经过漂白,导致受体失活,阻止供体进行任何福斯特能量转移。

‍敏化发射方法

‍敏化发射方法

具有全空间和时间分辨率的FRET

敏化发射可在活细胞成像模式下进行测量,并对FRET事件进行精准定位。此方法需要记录参考样品以及单独的供体和受体光谱,但在分析向导的帮助下,可以轻松完成图像校正。针对不同的分子密度,工具包提供了三种不同的优化算法。

下载

  • Analyze physiological time series data & acquire full flexibility

    Physiology for ZEISS ZEN Imaging Software

    920 KB
  • Pixel-precise bleaching & great range of calculation tools

    FRAP for ZEISS ZEN Imaging Software

    1 MB
  • Pixel-precise bleaching & impressive heat maps

    FRET for ZEISS ZEN Imaging Software

    736 KB


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